巩晶
所属院部: 生命科学学院
访问次数:
基本信息
  • 教师拼音名称:
    gongjing
  • 电子邮箱:
    gongjing@sdu.edu.cn
  • 入职时间:
    2010-10-08
  • 所在单位:
    生命科学学院
  • 职务:
    专职组织员
  • 学历:
    研究生(博士后)
  • 办公地点:
    山东大学(青岛)第周苑B座404室
  • 性别:
  • 联系方式:
    0532-58630822
  • 学位:
    博士
  • 在职信息:
    在职
  • 毕业院校:
    德国慕尼黑大学
曾获荣誉:

2021-05-30    山东大学生命科学学院2021年度优秀党务工作者;
教师简介

巩晶,德国慕尼黑大学生物信息学硕士、博士。以第一及通讯作者身份发表生物信息学相关SCI论文多篇,主持国家自然科学基金青年项目以及多项省部级科研课题。担任山东大学泰山学堂和山东大学基础医学院开设的多门生物信息学课程课程负责人和授课教师。普通高等教育“十三五”规划教材《生物信息学》编委。

教育经历
  • 2007-2 — 2010-5
    德国慕尼黑大学
    生物科学类
    博士
  • 2003-10 — 2007-1
    德国慕尼黑大学
    生物科学类
    硕士
  • 1998-9 — 2002-6
    青岛海洋大学
    海洋生物科学
    学士
工作经历
  • 2010-3 — 2010-6
    德国巴伐利亚超级计算中心
  • 2010-10 — 2017-8
    山东大学基础医学院
  • 2017-9-至今
    山东大学生命科学学院
科研成果
研究方向
论文

1.  Tiandi Wei , Jing Gong , Guojing Qu , Mingyu Wang  and Hai Xu. Interactions between Yersinia pestis V-antigen (LcrV) and human Toll-like receptor 2 (TLR2) in a modelled protein complex and potential mechanistic insights.  20,  2019. 

2.  Yanling Liu , Zhongjuan Zhao , Zheyong Xue , Long Wang , Yunfei Cai , PengWang , Tiandi Wei , Jing Gong , Zhenhua Liu , Juan Li , Shuo Li  and Fengning Xiang. An Intronless β-amyrin Synthase Gene is More Efficient in Oleanolic Acid Accumulation than its Paralog in Gentiana straminea.  Scientific reports,  6,  33364, 2016. 

3.  Jisheng Guo , Xiaoyue Wang , Xin Lü , Ruirui Jing , Junqiang Li , CuiLing Li , Daoguang Wang , Baibin Bi , Xinjun Chen , Fengqin Wang , Shengnan Sun , Jing Gong , Kazem M. Azadzoi  and Jing-Hua Yang. Unraveling molecular effects of ADAR1 overexpression in HEK293T cells by label-free quantitative proteomics.  Cell Cycle,  15,  1591, 2016. 

4.  Weixin Zhang , Yanli Cao , Jing Gong , Xiaoming Bao , Guanjun Chen  and Weifeng Liu. Identification of residues important for substrate uptake in a glucose transporter from the filamentous fungus Trichoderma reesei.  Sci Rep,  5,  13829, 2015. 

5.  Jiangfeng Lan , Xincang Li , Jiejie Sun , Jing Gong , Xianwei Wang , Xiuzhen Shi , Lijie Shi , Yuding Weng , Xiaofan Zhao  and Jinxing Wang. Prohibitin interacts with envelope proteins of white spot syndrome virus and prevents infection in red swamp crayfish Procambarus clarkia.  JOURNAL OF VIROLOGY,  87(23),  12756-65, 2013. 

6.  Baojun Wu , Jing Gong , Shoudao Yuan , Ying Zhang  and Tiandi Wei. Patterns of evolutionary selection pressure in the immune signaling protein TRAF3IP2 in mammals.  Gene,  531,  403, 2013. 

7.  Hua Cong , Min Zhang , Qingli Zhang , Jing Gong , Haizi Cong , Qing Xin  and Shenyi He. Analysis of structures and epitopes of surface antigen glycoproteins expressed in bradyzoites of Toxoplasma gondii.  Biomed Research Internal,  2013,  1065432, 2013. 

8.  Yan Pan , Dongyan Zheng , Shangming Liu , Yan Meng , Hongyan Xu , Qing Zhang , Jing Gong , Zuoli Xia , Lianbi Chen  and Hongyu Li. Hydroxysafflor yellow A attenuates lymphostatic encephalopathy- induced brain injury in rats.  PHYTOTHERAPY RESEARCH,  26(10),  1500-1506, 2012. 

9.  Xiuhua Liu , Jing Gong , Tiandi Wei , Zhi Wang , Qian Du , Deyu Zhu , Yan Huang , Sujuan Xu  and Lichuan Gu. Crystal structure of HutZ, a heme storage protein from Vibrio cholerae: A structural mismatch observed in the region of high sequence conservation.  BMC Structural Biology,  12,  23, 2012. 

10.  Baojun Wu , Jing Gong , Lanlan Liu , Tianren Li , Tiandi Wei  and Zengliang Bai. Evolution of prokaryotic homologues of the eukaryotic SEFIR protein domain.  GENE,  492(1),  160-166, 2012. 

11.  Baojun Wu , Tianxiao Huan , Jing Gong , Pin Zhou  and Zengliang Bai. Domain combination of the vertebrate-like TLR gene family: implications for their origin and evolution.  JOURNAL OF GENETICS,  90(3),  401-408, 2011. 

12.  Baojun Wu , Meng Jin , Jing Gong , Xiumin Du  and Zengliang Bai. Dynamic evolution of CIKS (TRAF3IP2/Act1) in metazoans.  DEVELOPMENTAL AND COMPARATIVE,  35(11),  1186-1192, 2011. 

13.  Maciej Lech , Veronika Skuginna , Onkar P. Kulkarni , Jing Gong , Tiandi Wei , Robert W. Stark , Cecilia Garlanda , Alberto Mantovani  and Hans-Joachim Anders. Lack of SIGIRR/TIR8 aggravates hydrocarbon oil-induced systemic lupus.  JOURNAL OF PATHOLOGY,  220(5),  596-607, 2011. 

14.  Jing Gong , Tiandi Wei , Robert W. Stark , Ferdinand Jamitzky , Wolfgang M. Heckl , Hans J. Anders , Maciej Lech  and Shaila C. Rössle. Inhibition of the Toll-like receptors TLR4 and 7 signaling pathways by SIGIRR: a computational approach.  JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY,  169,  323-330, 2010. 

15.  Jing Gong , Tiandi Wei , Ning Zhang , Ferdinand Jamitzky , Wolfgang M. Heckl , Shaila C. Rössle  and Robert W. Stark. TollML: a Database of Toll-like Receptor Structural Motifs.  JOURNAL OF MOLECULAR MODELING,  17,  27-36, 2010. 

16.  Tiandi Wei , Jing Gong , Ferdinand Jamitzky , Wolfgang M. Heckl , Robert W. Stark  and Shaila C. Rössle. A leucine-rich repeat assembly approach for homology modeling of human TLR5-10 and mouse TLR11-13 ectodomains.  JOURNAL OF MOLECULAR MODELING,  17,  27-36, 2010. 

17.  Johannes Assfalg , Jing Gong , Hans-Peter Kriegel , Alexey Pryakhin , Tiandi Wei  and Arthur Zimek. Investigating a correlation between subcellular localization and fold of proteins.  JOURNAL OF UNIVERSAL COMPUTER SCIENCE,  16(5),  604-621, 2010. 

18.  Tiandi Wei , Jing Gong , Ferdinand Jamitzky , Wolfgang M. Heckl , Robert W. Stark  and Shaila C. Rössle. Homology modeling of human Toll-like receptors TLR7, 8 and 9 ligand-binding domains.  PROTEIN SCIENCE,  18,  1684-1691, 2009. 

19.  Johannes Assfalg , Jing Gong , Hans-Peter Kriegel , Alexey Pryakhin , Tiandi Wei  and Arthur Zimek. Supervised ensembles of prediction methods for subcellular localization.  JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY,  7(2),  269-85, 2009. 

20.  Tiandi Wei , Jing Gong , Ferdinand Jamitzky , Wolfgang M. Heckl , Robert W. Stark  and Shaila C. Rössle. LRRML: a conformational database and an XML description of leucine-rich repeats (LRRs).  BMC STRUCTURAL BIOLOGY,  8,  47, 2008. 

科研项目

1. 国家自然科学基金青年项目(主持):耶尔森氏菌LcrV结合Toll样受体2的结构机制研究, 2015/08/17-2018/12/31

2. 教育部留学回国人员科研启动基金(主持):Toll样受体与接头蛋白胞内TIR域相互作用的结构预测和动力学模拟, 2012/01/01-2013/12/31

3. 中国博士后科学基金第五批特别资助(主持):TLR信号传导中重要蛋白质的结构预测及相互作用研究-2013/12/31

4. 山东省优秀中青年科学家科研奖励基金(主持):Toll样受体信号传导中重要蛋白质分子的结构预测及相互作用研究, 2012/07/01-2014/12/31

5. 高等学校博士学科点专项科研基金(主持):TIR蛋白质域在Toll样受体胞内信号转导中相互作用的结构机制研究, 2012/01/01-2015/12/31

6. 国家高技术研究发展计划(863计划)课题(第六位):卵巢癌的蛋白质分子网络研究-2016/12/31

7. 山东省科技重大专项项目(第三位):消化道肿瘤氨基酸多样性大数据库及其精准医学相关技术的研究, 2015/01/01-2017/12/31

8. 山东省重点研发计划(第三位):非编码氨基酸及其精准医疗技术, 2016/11/01-2018/12/31

9. 国家自然科学基金面上项目(第三位):一种具潜力的弓形虫新型蛋白TgDOC2.1功能及作用机制的全面研究, 2012/08/17-2013/12/31

10. 国家自然科学基金面上项目(第四位):内源性双链RNA的产生及其信号转导, 2014/08/15-2018/12/31

11. 国家自然科学基金青年项目(第二位):富亮氨酸重复序列的预测、分类及配体识别的结构机制研究, 2013/08/15-2016/12/31

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