洪烨：教授，博士生导师，独立PI，课题组组长。2005年本科毕业于山东大学。2011年博士毕业山东大学微生物技术国家重点实验室。博生期间在德国马克斯普朗克陆地微生物所进行联合培养。毕业之后，先后在英国邓迪大学基因调控和表达研究中心和英国医学研究理事会蛋白质磷酸化与泛素化研究中心从事博士后工作。2019年回国工作，任山东大学齐鲁青年学者，主要利用模式动物秀丽隐杆线虫，研究生殖细胞和早期胚胎中的基因组稳定性维持的分子机理。作为通讯作者，其研究成果在Science, Science Advances, PLOS Biology, Nuclei Acids Research和PLoS Pathogens等国际知名期刊发表。同时，实验室与环境科学和医学等领域专家合作，例如参与开发新型光催化材料降解水中全氟和多氟烷基物质（主要负责毒理评价, Nature Water, 2026; Water Research, 2026），以及参与解析人类早发性卵巢功能不全的遗传风险因素（Fundamental Research, 2025）。此外，担任期刊《Genome Instability & Disease》青年编委, 并担任多家国际知名期刊，如Genes & Development、PLoS Biology等的审稿人。

研究方向

生殖细胞和早期胚胎中的基因组稳定性维持机理以及与卵巢早衰，非梗阻性无精症等配子发生失败的遗传机制研究

具体研究领域：

1. 多细胞动物复制体新组分的鉴定和功能分析

DNA复制是最基本的生物学过程之一，负责细胞中最重要的遗传信息的传递。DNA复制紊乱所产生的缺陷会导致细胞基因组不稳定，是涉及人类衰老以及癌症等诸多重大疾病的重要因素。尤其是胚胎发育早期会经历一个细胞快速增殖和分裂的过程，此时DNA复制会面临巨大的压力，其精确调控直接决定了早期胚胎的质量，从而影响生物个体后期的生长和发育。迄今为止，对于真核生物DNA复制的基本认识主要来源于单细胞真核生物酿酒酵母，而对于多细胞动物的DNA复制过程了解较少。

      本实验室和合作者利用模式动物线虫，系统地鉴定了多细胞动物中承担DNA复制的大分子机器-复制体的组分，发现与小头畸形侏儒症（Microcephalic Primordial Dwarfism, MPD）密切相关的DONSON基因dnsn-1在DNA复制起始过程中发挥的重要功能，并进一步阐明了DNSN-1蛋白介导的DNA解旋酶CMG复合物在复制起始位点组装的具体机制，揭示了多细胞后生动物的DNA复制起始与单细胞酿酒酵母之间的显著差异。该研究弥补了模式生物酿酒酵母在小头畸形侏儒症等复制缺陷相关复杂疾病研究中的不足，为更深层次地探究后生动物DNA复制起始的分子机制提供了新的方向，也为相关疾病的诊治奠定了重要基础（Science, 2023）。

2. 减数分裂中参与交叉重组形成的促交叉复合物的组装和解离机制

与早期胚胎细胞不同，生殖细胞在减数分裂过程中会程序性地引发DNA双链断裂。这些DNA双链断裂通过同源重组修复，促使来自于父本和母本的同源染色体间进行遗传物质的交换，从而增加了后代的遗传多样性，同时也能够在染色体间形成短暂连接，保证后期染色体的精确分离。交叉重组过程复杂且受到一类保守的促交叉形成蛋白的严格调控，其异常会生殖细胞基因组不稳定，是造成人类不孕不育的重要原因。然而目前不清楚这些促交叉形成蛋白在交叉重组中的作用机制。

       本实验室解析了促交叉形成蛋白间的相互作用，明确了蛋白互作对于减数分裂交叉重组的重要影响，揭示了促交叉形成蛋白复合体促进减数分裂前期交叉形成的作用机制（Science Advances, 2026; PLoS Biology, 2026; Nucleic Acids Research, 2024）。该研究不仅可以帮助我们更好地了解生殖细胞的基因组维持机理，也为配子发生失败的遗传机制提供了新的视角，同时也为丰富不孕不育基因的筛查清单提供更多的理论依据。

发表文章 (^#第一作者，*通讯作者)

           2026年

1.  Liu G, Yang Y, Nan W, Xiao T, Guo Z, Zhang M, Wang Y, Wu X, Gartner A, Zhang H*, Hong Y* (最后通讯). COSA-1-SLX-4 interaction directly links crossover designation with Holliday junction resolution. Science Advances. (2026);12(17):eadx9148. 

2. Zhang H, Liang W, Li M, Yang Y, He L, Nan W, Liu G, Wang B, Hong Y*(独立通讯). Ubiquitin-proteasome system regulates pro-crossover protein dynamics during meiosis in Caenorhabditis elegans. PLoS Biology. 2026 Jun 16;24(6):e3003868.

3. Wang S, Han W, Zhao B, Hong Y*(共同通讯), Li J*, Miao J*, Lin Z*. A novel SO2 probe inhibits lysophagy induced by Senecavirus A infection by promoting LAMP1 Cys375 sulfenylation. PLoS Pathogens. (2026);22(2):e1013932.

4. Nan W, Li P, Liu G, He L, Zhang M, Gao H, Wang B, Yu Z, Zhang H, Li A*, Hong Y*(最后通讯). RBPL-1 Promotes Meiotic Homolog Pairing Through Its Conserved DWNN Domain in Caenorhabditis elegans.FASEB Journal. (2026);40(9):e71869.

5. Liu F, Li H, Gao Z, Song Q, Cullen P J, Nie Z, Hong Y, Zhang Y, Yao S, Gu C, Meng F, Zuo Z, Liu R*, Chen Z*, Ma D, Yin Y, Cai Y, Duan X*, Zhang Q*. Steering charge transfer in CuInS2/BiOCl composites to enable sunlight-driven C–F bond cleavage of PFAS in water. Nature Water(2026); 4, 334–347.

6. Song X, Xue H, Li H, Liang J, Ji X, Song Q, Cullen PJ, Hong Y, Liu R, Duan X, Zhang Q, Yin Y, Cai Y. Burstein-Moss band engineering of amine-functionalised In2S3 for visible-light photocatalytic degradation of PFAS. Water Research. 2026 Jul 12;305:126489.

2025年

1. Xi Y, Liu J, Zhao Y, Hong Y*(独立通讯). Breaking the stability paradox: mScarlet3-H enables long-term super-resolution and CLEM imaging. The Innovation Life (2025); 3:100174.

2.  Li Y, Cao Z, Gao J, Xu P, Gao Y, He L, Ji W, Qin Y, Hong Y, Guo T*, Wang Y*. Genetic variants in the homologous recombination pathway as common risk for premature ovarian insufficiency and ovarian cancer. Fundamental Research (2025)

3. Song J, Geary P, Salemova K, Rouse J, Hong Y, Rolland SGM, Gartner A. Functional dissection of the conserved C. elegans LEM-3/ANKLE1 nuclease reveals a crucial requirement for the LEM-like and GIY-YIG domains for DNA bridge processing. Nucleic Acids Research. (2025). gkaf265.

2024年

1. Yang Y, Wang N, Liu G, Nan W, Wang B, Gartner A, Zhang H*, Hong Y*(最后通讯). COSA-1 mediated pro-crossover complex formation promotes meiotic crossing over in C. elegans. Nucleic Acids Research, (2024). gkae130

2.Odiba AS, Liao G, Ezechukwu CS,Liao G, Hong Y, Fang W,Jin C, Gartner A, Wang B. SMC-5/6 complex subunit NSE-1 plays a crucial role in meiosis and DNA repair in Caenorhabditis elegans. DNA repair.(2024).103669

2023年

1.Xia Y, Sonneville R, Jenkyn-Bedford M, Ji L, Alabert C, Hong Y*(共同通讯), Yeeles JTP*, Labib KPM*. DNSN-1 recruits GINS for CMG helicase assembly during DNA replication initiation in Caenorhabditis elegans. Science. (2023);381(6664):eadi4932.

2.Odiba AS, Liao G, Ezechukwu CS, Zhang L, Hong Y, Fang W, Jin C, Gartner A, Wang B. Caenorhabditis elegansNSE3 homolog (MAGE-1) is involved in genome stability and acts in inter-sister recombination during meiosis. Genetics. (2023);225(2):iyad149. 

其他文章

1. Ji LQ, Hong Y, Tao YX. Melanocortin-5 Receptor: Pharmacology and Its Regulation of Energy Metabolism. International Journal of Molecular Sciences. (2022);23(15):8727.

2. Hong Y*(共同通讯), Zhang H, and Gartner A*. The Last Chance Saloon. Frontiers in Cell and Developmental Biology (2021)9, 671297.

3.Meier B, Volkova NV, Hong Y, Bertolini S, González-Huici V, Petrova T, Boulton S, Campbell PJ, Gerstung M, Gartner A. Protection of the C. elegans germ cell genome depends on diverse DNA repair pathways during normal proliferation. PLOS One. (2021);16(4):e0250291.

4.Hong Y#,Sonneville R,Wang B,Woglar A,Labib K,Jantsch V,Gartner A*.LEM-3 is a midbody- tethered DNA nuclease that resolves chromatin bridges during late mitosis. Nature Communications (2018),9,728

5.Hong Y# ,Velkova M,Silva N,Jagut M,Scheidt V,Labib K,Jantsch V andGartner A*.Theconserved LEM-3/Ankle1 nuclease is involved in meiotic recombination and chromosome segregation in Caenorhabditis elegans. PLOS Genetics (2018) 14(6): e1007453.

6.Meier B, Volkova N, Hong Y, Schofield P, Campbell PJ, Gerstung M*, Gartner A*.Mutational signatures of DNA mismatch repair deficiency in C. elegans and human cancers.Genome Research(2018), 28(5):666-675

7. Bertolini S, Wang B, Meier B, Hong Y, Gartner A*. Caenorhabditis elegans BUB-3 and SAN-1/MAD3 Spindle Assembly Checkpoint Components Are Required for Genome Stability in Response to Treatment with Ionizing Radiation. G3 (Bethesda). 2017;7(12):3875-3885. 

8.Hong Y#,Sonneville R,Agostinho A, Meier B, Wang B,Blow J,Gartner A*. TheSMC-5/6 complex and the HIM-6 (BLM) helicase synergistically promote meioticr ecombination intermediate processing and chromosome maturation during C.elegans meiosis.PLOS Genetics(2016) 24;12(3):e1005

9.Shlien A*, Campbell BB, deBorja R, Alexandrov LB, Merico D, Wedge D,VanLoo P, Tarpey PS, Coupland P,Behjati S, Pollett A, Lipman T, Heidari A,Deshmukh S,Avitzur N,Meier B,Gerstung M,Hong Y, Merino DM, Ramakrishna M,Remke M,ArnoldR,PanigrahiGB,Thakkar NP, Hodel KP, Henninger EE,Göksenin AY,Bakry D,Charames GS,Druker H,Lerner-Ellis J, Mistry M,Dvir R,Grant R,Elhasid R,Farah R,Taylor GP,Nathan PC,Alexander S,Ben-Shachar S,Ling SC,Gallinge rS,Constantini S,Dirks P,Huang A,Scherer SW,Grundy RG,Durno C,Aronson M,Gartner A,Meyn MS,Taylor MD,Pursell ZF,Pearson CE,Malkin D,Futreal PA,Stratton MR,Bouffet E,Hawkins C,CampbellPJ,TaboriU; Biallelic Mismatch Repair Deficiency Consortium. Combined hereditary and somatic mutations of replication error repair genes result in rapid onset of ultra-hyper mutated cancers.Nat Genetics.(2015),3,257-262.

10.Hong Y#, Wang Z, Zhang Z, Ma X, Ni J, Sheng D, Shen Y*. Dissection of the functional domains of an archaeal Holliday junction helicase. DNA repair. (2012),2,102-111