《合成生物学》期刊2024年度优秀论文评选,经过期刊官网和知网等数据筛选、编委会多重评审、公开投票等环节,最终有10篇优秀论文脱颖而出,山东大学微生物技术国家重点实验室王海龙课题组发表于《合成生物学》期刊2022年第1期的研究论文“ExoCET-BAC策略高效抓取和组装高AT含量基因组大片段”名列其中。山东大学王海龙教授和张友明教授为论文通讯作者,博士后姜婵娟为论文第一作者。本研究得到了厦门大学、山东大学焦念志教授和山东大学符军教授的支持。
基因克隆是解析基因功能的重要手段,但仍有很多基因难以克隆,比如高AT含量(>60%)基因组来源的DNA。ExoCET克隆技术是通过联合核酸外切酶介导的体外同源重组和大肠杆菌RecET重组酶介导的细胞内同源重组,迄今未有利用ExoCET技术从AT含量>63%的基因组克隆大片段的报道。本研究以AT含量为69%的海洋单细胞光合蓝细菌原绿球藻MIT 9301菌株的基因组为研究对象,探究了利用ExoCET技术进行高AT含量基因组大片段克隆的最佳条件。结果显示:(1)在核酸外切酶介导的体外同源重组时使用Gibson体系较T4聚合酶体系能获得更高的克隆效率;(2)载体应该选择单拷贝的细菌人工染色体(BAC),多拷贝质粒载体会导致克隆失败;(3)ExoCET可以从原绿球藻基因组上抓取>80 kb的大片段,并且能以100%的正确率组装11个3 kb的DNA片段;(4)可以一步同时抓取4个7-20 kb的基因组大片段。大规模基因组测序显示高AT含量生物占比超过30%,该研究建立的ExoCET-BAC策略将为高AT含量生物的基因组功能研究提供高效使能技术。
“《合成生物学》期刊2024年度优秀论文”从2022-2023年发表在《合成生物学》期刊的文章中选出。《合成生物学》期刊是中国生物工程学会会刊、是我国目前唯一专注于合成生物学领域的中文科技期刊。自2020年创刊以来,正式出版纸刊27期、共337篇,在线出版共计396篇,已经在国内合成生物学领域形成了广泛影响力,已被北大中文核心期刊、中国科技核心期刊、CSCD核心库、CAS数据库收录。