孙端辰，1990年生，教授、博士生导师。2012年毕业于山东师范大学数学与统计学院信息与计算科学专业，获学士学位。2017年毕业于中国科学院数学与系统科学研究院运筹学与控制论专业，获博士学位（导师：吴凌云研究员）。博士毕业后，于2017年7月至2021年8月赴美国俄勒冈健康与科学大学医学院读博士后，研究方向为生物信息学。2022年入职山东大学数学学院。

主要从事数学、机器学习与前沿生物医学问题的交叉研究，工作涉及生物信息学与大数据分析等领域。在生物标记物的识别，单细胞数据的计算问题等研究上取得了一系列成果。目前已在包括Nature Biotechnology (IF：68.2)、Nature Communications (IF: 17.7)、Briefings in Bioinformatics (IF：14.0)、Clinical Cancer Research (IF：13.8) 等国际著名学术期刊上发表SCI论文二十余篇。

• 2012/09/01-2017/06/30
  中国科学院数学与系统科学研究院
  运筹学与控制论
• 2008/09/01-2012/06/30
  山东师范大学
  信息与计算科学

• 2017-7 — 2021-8
  Oregon Health & Science University

1. 运筹学，生物信息学

(1)Jiating Yu. Incorporating network diffusion and peak location information for better single-cell ATAC-seq data analysis .Briefings in Bioinformatics .2024 ,25 (2)

(2)Yang, Jiaxin. Multi-objective Optimization-Based Approach for Detection of Breast Cancer Biomarkers .2023 ,14088 LNCS :716-726

(3)Sun, Chenxi. Detecting Autism Spectrum Disorder from Functional Magnetic Resonance Imaging Data with an Ensemble Machine Learning Method .2023 :13-20

(4)Zhang, Chunxiao. MOFNet: A Deep Learning Framework of Integrating Multi-omics Data for Breast Cancer Diagnosis .2023 ,14088 LNCS :727-738

(5) CDK9 inhibition induces epigenetic reprogramming revealing strategies to circumvent resistance in lymphoma .Mol Cancer .2023 ,22 (1)

(6)Yu, Jiating. Network Refinement: Denoising complex networks for better community detection .PHYSICA A .2023 ,617

(7)Wang, Chuanyuan. ActivePPI: quantifying protein-protein interaction network activity with Markov random fields .Bioinformatics (Oxford, England) .2023 ,39 (9)

(8) Identifying phenotype-associated subpopulations by integrating bulk and single-cell sequencing data .Nature Biotechnology .2021

(9) Postpartum breast cancer has a distinct molecular profile that predicts poor outcomes .Nature Communications .2021

(10) BET bromodomain inhibition blocks an AR-Repressed, E2F1-Activated treatment-emergent neuroendocrine prostate cancer lineage plasticity program .Clinical Cancer Research .2021

(11) Discovering cooperative biomarkers for heterogeneous complex disease diagnoses .Briefings in Bioinformatics .2019

1. （包干项目）生物信息学, 2024/01/01-2026/12/31

2. 基于时空多组学数据的肿瘤时空特征算法开发, 2022/12/31-2024/12/31

3. （包干项目）生物信息计算与复杂疾病建模中的算法研究, 2023/07/05-2025/12/31

4. 分子尺度多组学数据的数学表征与耦合集成, 2022/12/01-2027/11/30

5. （包干项目）单细胞导向的复杂疾病生物标志物识别新方法研究, 2022/09/07-2025/12/31

6. 图理论和算法研究及其在生物信息学中的应用, National Natural Science Foundation, 参与，2016-2021