孙端辰，1990年生，教授、博士生导师。2012年毕业于山东师范大学数学与统计学院信息与计算科学专业，获学士学位；2017年毕业于中国科学院数学与系统科学研究院运筹学与控制论专业，获博士学位（导师：吴凌云研究员）；2017年7月至2021年8月在俄勒冈健康与科学大学（OHSH）奈特癌症研究所开展博士后研究，研究方向为生物信息学。2022年加入山东大学数学学院，获聘山东大学齐鲁青年学者（第一层次）。

主要从事数学、信息科学与前沿生物医学问题的交叉研究。围绕复杂疾病建模中的计算问题和挑战，开展原创性数学模型和算法设计，在高精度复杂疾病生物标志物识别、疾病发生发展过程中关键因素的可解释性等方面取得系列成果。以第一作者或通讯作者（含共同）在Nature Biotechnology、Molecular Cancer、Nature Communications、Advanced Science、Briefings in Bioinformatics、Clinical Cancer Research 等期刊发表论文三十余篇。现主持国家自然科学基金项目 1 项，参与国家重点研发计划课题 1 项、国自然重点项目 1 项。兼任中国运筹学会计算系统生物学分会理事，中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会委员，中国计算机学会生物信息学专委会通讯委员，山东省生物信息学会理事等学术职务。

• 2012/09/01-2017/06/30
  中国科学院数学与系统科学研究院
  运筹学与控制论
• 2008/09/01-2012/06/30
  山东师范大学
  信息与计算科学

• 2017-07 — 2021-08
  Oregon Health & Science University

1. 运筹学，生物信息学

(1)Li, Yunhai. Predicting Drug-Target Affinity Using Protein Pocket and Graph Convolution Network .2024 ,14954 LNBI :1-12

(2)Yu, Jiating. Reverse network diffusion to remove indirect noise for better inference of gene regulatory networks .Bioinformatics .2024 ,40 (7)

(3)吴秋琴. Identification of DNA motif pairs on paired sequences based on composite heterogeneous graph .Frontiers in Genetics .2024 ,15

(4)Jiating Yu. Incorporating network diffusion and peak location information for better single-cell ATAC-seq data analysis .Briefings in Bioinformatics .2024 ,25 (2)

(5)Yang, Jiaxin. Multi-objective Optimization-Based Approach for Detection of Breast Cancer Biomarkers .2023 ,14088 LNCS :716-726

(6)Sun, Chenxi. Detecting Autism Spectrum Disorder from Functional Magnetic Resonance Imaging Data with an Ensemble Machine Learning Method .2023 :13-20

(7)Zhang, Chunxiao. MOFNet: A Deep Learning Framework of Integrating Multi-omics Data for Breast Cancer Diagnosis .2023 ,14088 LNCS :727-738

(8) CDK9 inhibition induces epigenetic reprogramming revealing strategies to circumvent resistance in lymphoma .Mol Cancer .2023 ,22 (1)

(9)Yu, Jiating. Network Refinement: Denoising complex networks for better community detection .PHYSICA A .2023 ,617

(10)Wang, Chuanyuan. ActivePPI: quantifying protein-protein interaction network activity with Markov random fields .Bioinformatics (Oxford, England) .2023 ,39 (9)

(11) Identifying phenotype-associated subpopulations by integrating bulk and single-cell sequencing data .Nature Biotechnology .2021

(12) Postpartum breast cancer has a distinct molecular profile that predicts poor outcomes .Nature Communications .2021

(13) BET bromodomain inhibition blocks an AR-Repressed, E2F1-Activated treatment-emergent neuroendocrine prostate cancer lineage plasticity program .Clinical Cancer Research .2021

(14) Discovering cooperative biomarkers for heterogeneous complex disease diagnoses .Briefings in Bioinformatics .2019

1. （包干项目）生物信息学, 2024/01/01-2026/12/31

2. 基于时空多组学数据的肿瘤时空特征算法开发, 2022/12/31-2024/12/31

3. （包干项目）生物信息计算与复杂疾病建模中的算法研究, 2023/07/05-2025/12/31

4. 分子尺度多组学数据的数学表征与耦合集成, 2022/12/01-2027/11/30

5. （包干项目）单细胞导向的复杂疾病生物标志物识别新方法研究, 2022/09/07-2025/12/31

6. 图理论和算法研究及其在生物信息学中的应用, National Natural Science Foundation, 参与，2016-2021