Hao Wu

Associate Professor   Supervisor of Master's Candidates

Name (Simplified Chinese):Hao Wu

Name (English):Hao Wu

Name (Pinyin):Wu Hao

E-Mail:haowu@sdu.edu.cn

Date of Employment:2020-10-12

School/Department:Shandong University

Administrative Position:Associate Professor

Education Level:With Certificate of Graduation for Doctorate Study

Business Address:215a Office of scientific research building in Software Park Campus of Shandong University No.1500, Shunhua Road, high tech Zone, Jinan City, Shandong Province

Gender:Male

Contact Information:Email: haowu@sdu.edu.cn or haowu@nwsuaf.edu.cn Wechat: bioinformatics01

Degree:Doctor

Status:Employed

Academic Titles:Teaching and research, master's degree Supervisor

Other Post:Senior member of China Computer Association (CCF); Young and general project evaluation experts of NSFC; National Master's thesis evaluation expert; More than ten reviewers and guest editors of SCI Journals

Alma Mater:Xidian University

Whether on the job:0

Discipline:Other Majors of Software Engineering
Computer Applications Technology
Computer Science and Technology

Academic Honor:

Honors and Titles:

2021-12-20   山东大学软件学院优秀教师

2020-12-20   山东大学教师教学创新大赛三等奖

2018-07-10   西北农林科技大学信息工程学院本科毕业设计优秀指导教师

2016-12-25   西北农林科技大学青年教师讲课比赛二等奖,比赛现场评分第一名

2016-12-30   西北农林科技大学信息工程学院“特殊课时津贴”奖

2013-06-10   教改项目《计算机网络应用技术课程建设改革与实践》荣获西北农林科技大学教学成果二等奖

2009-10-10   西北农林科技大学 “优秀班主任”

2008-12-30   西北农林科技大学“校级优秀教师”


Profile


个人简介

吴昊,博士,副教授,硕士研究生导师,中国计算机学会(CCF)高级会员(No.73301S),中国人工智能学会生命和健康专委会委员BIIP, No.E661506634M),中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委委员(NCCBB,No.E441504848Z),山东生物信息学学会理事,担任《Current Genomics》,《CPQ Cancer》等国际期刊客座编辑,同时担任知名国际期刊Nucleic Acids Research》、《Briefing in Bioinformatics》、《IEEE-Transactions on Computational Biology and Bioinformatics》、《BMC Bioinformatics》、《IEEE Access》、《Briefings in Functional Genomics》、《BBA Gene Regulatory Mechanisms》等二十余家国际期刊审稿人,以及国内著名期刊《计算机科学》、《农业大数据学报》、《广西师范大学》等十余家期刊的特约审稿人;国家自然科学基金面上项目、青年项目通讯评审人;中国教育部学位中心硕士研究生毕业论文评审人。


招生信息

招生类别     招生专业(2023年度招生名额)

学术型硕士    软件工程(1人空缺),人工智能(1人空缺

专业型硕士    电子信息-软件工程(1人已满),电子信息-人工智能(1人空缺

欢迎致力于人工智能、数据挖掘、生物医学大数据挖掘等方向科学研究的本科生毕业生及山东大学软件学院本科在读生加入研究团队,一起为人类医学和健康贡献我们人工智能和数据挖掘方面的智慧和力量。



E-mail:haowu@sdu.edu.cn


主持的部分科研项目

主持国家重点研发计划子课题、国家自然科学基金面上项目、陕西省自然科学基金、教育部人文社科基金、杨凌区科技计划项目等科研项目10余项;

(12)国家自然科学基金面上项目,肿瘤染色质三维结构异质模式挖掘方法研究,项目编号:62272278, 2023.01~2026.12,主持;

(11)国家重点研发计划子课题,基于时间累积效应与空间层次效应的病例跨时空分析方法研究,项目编号:2021YFF0704103.32022.01~2025.12,主持

(10)国家自然科学基金面上项目,三维基因组调控层面的癌症致病通路挖掘方法研究,项目编号:619723222020.01~2023.12 主持;

(9)教育部中外语言交流中心重点项目,汉语学习智能对战平台建设,项目编号:YHJC22ZD084, 2023.01~2023.12, 主持

(8)陕西省自然科学基金面上项目,集成单细胞Hi-CmRNA序列数据致癌调控通路挖掘方法,项目编号:2021JM-1102021.01~2022.12,主持;

(7)中央高校基本科研业务费,基于深度学习的三维基因组调控元件检测方法研究,2021.01~2013.12,主持;

(6)陕西省自然科学基金面上项目,基于网络模型的癌症驱动通路和失调模块检测算法研究,项目编号:2017JM60632017.01~2018.12 , 主持;

(5)教育部人文社科交叉项目,一带一路语篇的话语权构建及其国际影响力研究,项目编号:18YJCZH190 2018.07~2021.06,主持;

(4)陕西省杨凌区科技计划项目,基于网络模型的癌症致病模式挖掘算法研究,项目编号:2017GY-032017.11~2019.10,主持;

(3)中央高校基本科研业务费,基于网络模型的癌症相关模式挖掘方法,项目编号:2452017342 2017.01~2019.12,主持;

2 博士科研启动经费,基于多源异构生物分子网络的致病基因预测, 项目编号:2452017019 2017.01~2019.12,主持;

(1)校人才基金规划项目,基于多源生物分子网络的癌症失调通路挖掘方法研究,项目编号:24520192352019.01~2021.12,主持。


主持和参与教学改革项目

(6)山东大学本科生院教改项目,数据结构课程思政建设与教学实践,项目编号:2021Y1002021.01-2022.12,主持;

(5)陕西省高等教育教学改革重点项目,基于大数据的学生评教影响因素与评教机制构建,2019.8-2021.73/4,参与

(4)西北农林科技大学,网络营销课程教学模式构建,2013.6-2015.61/4主持

(3)西北农林科技大学,基于语料库的专门用途英语教学平台构建,2013.6-2015.6 4/5,参与

2西北农林科技大学,程序设计实时自动批阅辅助教学平台建设,2011.6-2013.63/5,参与

(1)西北农林科技大学,计算机网络应用技术课程建设与实践2009.6-2011.62/5,参与


学术论文发表:以第一作者或通讯作者发表学术期刊论文40余篇,其中SCI/EI收录20余篇,主要发表在Nucleic Acids ResearchBioinformatics》、《Briefings in Bioinformatics》、《Engineering Applications of Artificial Intelligence》和《计算机学报》等国内外重要学术期刊;

主要代表作如下:(*代表通信作者,学生第一作者)

(12)  Pengyu Zhang, Hongming Zhang, Hao Wu*.  iPro-WAEL: A Comprehensive and Robust Framework for Identifying Promoters in Multiple Species.Nucleic Acids Research. 2022, DOI: 10.1093/nar/gkac824.(SCI, IF 19.4, 中科院1区, Top期刊)

(11) Pengyu Zhang, Yingfu Wu, Haoru Zhou, Bing Zhou, Hongming Zhang and Hao Wu*. CLNN-loop: A deep learning model to predict CTCF-mediated chromatin loops in the different cell lines and CTCF-binding sites (CBS) pair types. Bioinformatics, 2022, DOI10.1093/bioinformatics/btac575/6673906 (SCI IF 6.931, 中科院1区,Top期刊)

(10) Hao Wu*, Pengyu Zhang, Zhaoheng Ai, Leyi Wei, Fan Yang, Hongming Zhang, Lizhen Cui*. StackTADB: A Stacking-Based Ensemble Learning Model for Accurately Predicting the Boundaries of Topologically Associating Domains (TADs) in Fruit Flies[J]. Briefings in Bioinformatics, 2022, 23(2). DOI: 10.1093/bib/bbac023SCI, IF 13.99,  中科院1, Top期刊)

(9) Hao Wu*, Yingfu Wu, Yuhong Jiang, Bing Zhou, Haoru Zhou, Zhongli Chen, Yi Xiong, Quanzhong Liu and Hongming Zhang. scHiCStackL: A Stacking Ensemble Learning-based Method for Single-cell Hi-C Classification Using Cell Embedding [J]. Briefings in Bioinformatics, 2022, 23(1). DOI: 10.1093/bib/bbab396SCI, IF 13.99, 中科院1, Top期刊)

(8) Fan Yang, Shuaijie Zhang, Wei Pan, Ruiyuan Yao, Weiguo Zhang, Yanchun Zhang,  Qianghua Zhang, Yunlong Cheng, Jihua Dong, Chunyang Ruan*, Lizhen Cui*, Hao Wu*, Fuzhong Xue*. Signaling repurposable drug combinations against COVID-19 by developing the heterogeneous deep herb-graph method [J]. Briefings in Bioinformatics. 2022, 1-20 DOI: 10.1093/bib/bbac124.SCI, IF 13.99,  中科院1, Top期刊)

(7)Zhongli Chen , Biting Liang, Yingfu Wu, Hongming Zhang, Quanzhong Liu, Hao Wu*. Integrating Multi-Omics Data to Identify Dysregulated Modules in Endometrial Cancer. 2022, DOI:10.1093/bfgp/elac010. Briefings in Functional Genomics. SCI, IF 4.84,中科院3区)

(6) Hao Wu*, Zhongli Chen, Yingfu Wu, Hongming Zhang1, Quanzhong Liu. Integrating Protein Interaction Networks and Somatic Mutation Data to Detect Driver Modules in Pan-cancer. Interdisciplinary Sciences Computational Life Sciences, 2021, DOI : 10.1007/s12539-021-00475-y.SCI, IF 3.492, 中科院3区)

(5) Yingfu Wu, Bingyi Kang, Hao Wu*. Strategies of attack–defense game for wireless sensor networks considering the effect of confidence level in fuzzy environment. Engineering Applications of Artificial Intelligence, 2021, 102(11):104238. (SCI, IF 7.802, 中科院1)

(4) Xiao Liang, Fuyi Li, Jinxiang Chen, Junlong Li, Hao Wu, Shuqin Li, Jiangning Song and Quanzhong Liu*. Large-scale comparative review and assessment of computational methods for anti-cancer peptide identification [J]. Briefings in Bioinformatics, 2020, 00(00):1-17.SCI, IF 13.99, 中科院1区,Top期刊

(3) 吴昊*,基于突变基因网络的致癌驱动通路检测算法[J],计算机学报,2018, 41(6): 214-228. (CCF A 类)

(2) Hao Wu*, Lin Gao, Nikola Kasabov. Network-based method for inferring cancer progression at the pathway level from cross-sectional mutation data [J]. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB), 2016, 13(6): 1036-1044 (SCI, IF 3.702, CCF B 类)

(1) Hao Wu, Lin Gao*, Feng Li, et al. Identifying overlapping mutated driver pathways by constructing gene networks in cancer [J]. BMC Bioinformatics, 2015, 16 (5), 3. (SCI,  IF 3.307, CCF C 类)


分别参加在中国、新西兰举行的国际会议并做学术报告10余次,特邀大会报告3次;编写教材和专著3本;申请发明专利10部,软件著作权10余部。

Educational Experience

2012.9 -- 2016.12

西安电子科技大学       Computer Applications Technology       研究生       Doctor       西安电子科技大学计算机学院师从高琳教授从事生物大数据挖掘、计算生物信息学、深度学习、机器学习等方向的研究。

Social Affiliations

2016.1 -- Now

中国计算机协会(CCF)高级会员(No.73301M),中国计算机协会(CCF)专委会委员

2021.4 -- Now

人工智能学会生命与健康协会终身会员(BIIP,No.E661506634M),人工智能学会生命与健康专委会委员

2021.5 -- Now

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学协会会员(No.E441504848Z),中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委委员

2021.10 -- Now

山东生物信息学学会理事,自建立该协会之初,协助秘书长工作,举办会议等

2019.4 -- Now

担任SCI期刊“Current Genomics”和“CPQ Cancer”的客座编辑

2017.2 -- Now

担任SCI期刊《Transactions on Computational Biology and Bioinformatics》,《Briefings in Bioinformatics》,《IEEE Access》等十余个国际期刊及《计算机科学》、《广西师范大学学报》、《农业大数据学报》等二十多个国内核心期刊审稿专家。

Work Experience

2020.10 -- Now

山东大学      软件学院      副教授 硕士生导师      在职

2017.1 -- 2020.9

西北农林科技大学      信息工程学院      离职

2009.1 -- 2016.12

西北农林科技大学      信息工程学院      离职

2014.7 -- 2015.8

新西兰奥克兰理工大学      数据挖掘与知识发现研究所      合作研究

2006.7 -- 2008.12

西北农林科技大学      信息工程学院      党支部书记      助教      离职

2010.9 -- 2011.7

西安裕日责任有限公司      软件开发部      软件工程师      主要从事系统的架构,参与了三个项目的架构和开发