细菌转录后调控机制解析及相关元件的合成生物学应用：选择性RNA剪切和保护机制（Selective RNA Processing and Stabilization, SRPS）是细菌调节多顺反子操纵子内基因化学计量数的重要转录后调控机制，解决编码多顺反子操纵子内多基因同时调控和差异表达之间的矛盾，因其调控的系统性、定量化和广泛存在，其元件非常有希望成为标准化、通用性的定量化调控元件，在合成生物学中应用潜力巨大。

生物信息学：主要从事基于新一代测序数据的微生物生物信息学分析工作。