陈晓
教授
所属院部： 海洋学院
访问次数：次
基本信息
  • 教师英文名称：
    Xiao Chen
  • 教师拼音名称：
    Chen Xiao
  • 入职时间：
    2022-01-04
  • 所在单位：
    海洋学院
  • 性别：
    男
  • 联系方式：
    xc@sdu.edu.cn
  • 学位：
    博士生
  • 博士生导师
  • 硕士生导师
学科：
动物学；
曾获荣誉：

2023年 国家海外高层次人才；
2023年 山东大学“杰出中青年学者”；
2022年 青岛市科学技术奖自然科学奖一等奖；
2022年 山东大学“齐鲁青年学者”；
2019年 山东省优秀博士毕业论文；
2017年 国际原生生物学家学会“Holz-Conner”奖；
学术荣誉：

2023    国家优秀青年基金获得者；
2023    省高端人才；
教师简介

        教授、博士生导师，国家海外高层次人才，山东省高等学校优秀青年创新团队带头人，山东大学交叉学科培育项目团队负责人，山东大学“杰出中青年学者”。现任中国动物学会原生动物学分会理事、SCI 期刊 Discover Oncology 编委等。

        聚焦“细胞稳态的表观遗传调控与进化”开展系列研究，成果发表在 Nature Communications、PNAS、Molecular Cell 等国际顶尖学术刊物上。有关表观遗传因子 MEN1 和 PRC2 间的协同依赖关系的工作被评价为“一个至关重要的发现，将为当前和未来的药物研发提供关键信息”；有关组蛋白突变 H3K36M 的研究成果被评价为“揭示了组蛋白突变影响基因转录的关键因子”。

        荣获国际原生生物学家学会颁发的“Holz-Conner奖”和青岛市科学技术奖自然科学奖一等奖，入围中国青年报首届“海洋强国青年科学家”评选。现主持国家海外高层次人才项目、国家自然科学基金面上项目、山东省高等学校优秀青年创新团队等项目。


个人主页：https://faculty.sdu.edu.cn/xc

课题组主页：https://faculty.sdu.edu.cn/chenlab


博士、硕士招生专业：海洋科学（学术）、生物与医药（专业）

欢迎生物学、化学、计算机科学等教育背景，有表观遗传学、基因组进化研究热情的同学报考本课题组研究生！

有兴趣请发邮件：xc@sdu.edu.cn


教育经历
  • 2016-10 — 2017-9
    美国密歇根大学
    医学院
    国家公派联合培养博士
  • 2012-9 — 2018-1
    中国海洋大学
    水生生物学
    理学博士学位
  • 2008-9 — 2012-7
    中国海洋大学
    生物科学
    理学学士
工作经历
  • 2024-01-至今
    山东大学，海洋学院
    教授（杰出中青年学者）
  • 2022-01 — 2023-12
    山东大学，海洋学院
    研究员（齐鲁青年学者）
  • 2021-04 — 2021-09
    美国哥伦比亚大学，遗传发育系
    副研究员
  • 2018-04 — 2021-04
    美国哥伦比亚大学，遗传发育系
    博士后研究员
研究领域

细胞稳态的表观遗传调控与进化

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科研成果
论文

1.  [Nucleic Acids Research, 2025] Comprehensive genome annotation of the model ciliate Tetrahymena thermophila by in-depth epigenetic and transcriptomic profiling. 

2.  [Science China Life Sciences, 2025] Unveiling an ancient whole-genome duplication event in Stentor, the model unicellular eukaryotes. 

3.  [Cell, 2024] SMARCAL1 is a dual regulator of innate immune signaling and PD-L1 expression that promotes tumor immune evasion. 

4.  [Science Advances, 2024] Epigenetic regulation of p63 blocks squamous-to-neuroendocrine transdifferentiation in esophageal development and malignancy. 

5.  [Nature Communications, 2024] Rosiglitazone and trametinib exhibit potent anti-tumor activity in a mouse model of muscle invasive bladder cancer. 

6.  [Cell Reports, 2024] Metabolic reprogramming by histone deacetylase inhibition preferentially targets NRF2-activated tumors. 

7.  [Science China Life Sciences, 2024] Genes and proteins expressed at different life cycle stages in the model protist Euplotes vannus revealed by both transcriptomic and proteomic approaches. 

8.  [BMC Biology, 2024] Genomic insights into the cellular specialization of predation in raptorial protists. 

9.  [BMC Genomics, 2024] Decryption of the survival "black box": gene family expansion promotes the encystment in ciliated protists. 

10.  [European Journal of Protistology, 2024] Single-cell transcriptomic analysis reveals genome evolution in predatory litostomatean ciliates. 

11.  [Cell, 2023] Single substitution in H3.3G34 alters DNMT3A recruitment to cause progressive neurodegeneration. 

12.  [Nature Communications, 2023] Context-defined cancer co-dependency mapping identifies a functional interplay between PRC2 and MLL-MEN1 complex in lymphoma. 

13.  [Nucleic Acids Research, 2023] Annotation and evaluation of base editing outcomes in multiple cell types using CRISPRbase. 

14.  [Molecular Phylogenetics and Evolution, 2023] New evidence of consistency between phylogeny and morphology for two taxa in ciliated protists, the subclasses Oligotrichia and Choreotrichia (Protista, Ciliophora). 

15.  [Marine Life Science & Technology, 2023] Comparative genome analysis of three euplotid protists provides insights into the evolution of nanochromosomes in unicellular eukaryotic organisms. 

16.  [Marine Life Science & Technology, 2023] Invasion by exogenous RNA: cellular defense strategies and implications for RNA inference. 

17.  [European Journal of Protistology, 2023] Single-cell transcriptome reveals cell division-regulated hub genes in unicellular eukaryote Paramecium. 

18.  [Molecular Cell, 2022] Histone methylation antagonism drives tumor immune evasion in squamous cell carcinomas. 

19.  [PNAS, 2022] CHAF1A/B mediate silencing of unintegrated HIV-1 DNAs early in infection. 

20.  [Cell, 2021] Functional interrogation of DNA damage response variants with base editing screens. 

21.  [PNAS, 2021] Depletion of H3K36me2 recapitulates epigenomic and phenotypic changes induced by the H3.3K36M oncohistone mutation. 

22.  [Nature Genetics, 2021] Two competing mechanisms of DNMT3A recruitment regulate the dynamics of de novo DNA methylation at PRC1-targeted CpG islands. 

23.  [Nature Communications, 2021] Pparg signaling controls bladder cancer subtype and immune exclusion. 

24.  [Molecular Cell, 2021] Histone H3.3 K27M and K36M mutations de-repress transposable elements through perturbation of antagonistic chromatin marks. 

25.  [EMBO Reports, 2021] The interplay between DNA and histone methylation: molecular mechanisms and disease implications. 

26.  [Nature, 2019] The histone mark H3K36me2 recruits DNMT3A and shapes the intergenic DNA methylation landscape. 

27.  [Molecular Ecology Resources, 2019] Genome analyses of the new model protist Euplotes vannus focusing on genome rearrangement and resistance to environmental stressors. 

28.  [Molecular Ecology Resources, 2018] GPSit: an automated method for evolutionary analysis of nonculturable ciliated microeukaryotes. 

29.  [Nucleic Acids Research, 2017] N6-adenine DNA methylation is associated with H2A.Z-containing well-positioned nucleosomes in Pol II-transcribed genes in Tetrahymena. 

30.  [Science China Life Sciences, 2016] Enzymatic and chemical mapping of nucleosome distribution in purified micro- and macronuclei of the ciliated model organism, Tetrahymena thermophila. 

31.  [Protein & Cell, 2015] Phylogenomics of non-model ciliates based on transcriptomic analyses. 

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