孙磊：教授，博士/硕士生导师，国家自然科学基金优秀青年科学基金获得者，山东省“泰山学者”青年专家，山东大学“齐鲁青年学者”，山东大学“杰出中青年学者”。

    本科毕业于山东大学泰山学堂，在清华大学获得博士学位，并进行博士后研究。于2022年底加入山东大学生命科学学院作为独立PI，建立RNA系统生物学实验室。

    我们实验室主要通过整合分子生物学，系统生物学以及人工智能的方法，利用测序的方法研究RNA结构对转录后调控的影响，并应用在RNA疫苗设计、RNA病毒药物开发等方面。在RNA结构组领域取得一系列重要成果，相关工作以第一作者或共同通讯作者发表在Cell，Nature Methods，Cell Research，Nature Structural & Molecular Biology，Nucleic Acids Research等杂志。担任

Genomics, Proteomics & Bioinformatics、Advanced Biotechnology等期刊青年编委；担任Nature Communications、Nucleic Acids Research等期刊审稿专家。孙磊博士曾获得清华大学优秀博士后，清华北大生命联合中心特等博士后、泰山学者青年专家等奖励，获得国家自然科学基金、博士后基金、重点实验室开放基金等基金支持。

    作为一个交叉实验室，我们既欢迎做湿实验的同学，也欢迎做分析的同学。同时，我们与“数学与交叉科学研究中心”联合招收具有数学、计算机研究背景的博士生。我们团队正在寻找对RNA结构、RNA调控、生物信息学分析和人工智能感兴趣的硕士、博士、博士后和研究助理。我们为我们的工作感到自豪，并努力做严谨的科学工作。

我们与清华大学张强锋实验室具有长期合作，你将有机会在清华大学进行联合培养。同时，你也将有机会与病毒学、胚胎发育、微生物和单细胞等方面的顶尖专家合作。我的目标是为实验室学习的同学提供充分的指导、培训和支持，使你们能在学术界或工业界获得成功。

Selected Publications (# 第一作者，*通讯作者)：

1.     Orel Mizrahi#, Meredith Corley#, Ori Feldman#, Thorben Fröhlking#, Lei Sun#, Alison Ziesel#, Maciej Antczak, Mattia Bernetti, Shaimae I Elhajjajy, Wenze Huang, Grady Nguyen, Samuel Park, Raul Martell, Luke Trinity, Kui Xu, Tomasz Zok, Giovanni Bussi, Hosna Jabbari, Yaron Orenstein, Sharon Aviran, Michelle Meyer, Gene Yeo. Evaluation of novel computational methods to identify RNA-binding protein footprints from structural data, RNA. 080215.124 (2025). 

2.     Lu S.#, Y. Tang#, S. Yin, L. Sun*. RNA structure: implications in viral infections and neurodegenerative diseases. Advanced Biotechnology, 2(3), (2024).

3.     Xu, Y. #, J. Zhu#, W. Huang#, K. Xu, R. Yang, Q.C. Zhang*, and L. Sun*. PrismNet: predicting protein–RNA interaction using in vivo RNA structural information. Nucleic Acids Research, gkad353 (2023). 

4.     Zhang, J. #, Y. Fei#, L. Sun*, Q.C. Zhang *. Advances and opportunities in RNA structure experimental determination and computational modeling, Nature Methods 19 (10), 1193-1207 (2022).

5.     Sun, Lei #, P. Li#, X. Ju#, J. Rao#, W. Huang#, L.Ren, S. Zhang, T. Xiong, K. Xu, X. Zhou, M. Gong, E. Miska, Q. Ding *, J. Wang *, Q.C. Zhang *. In vivo structural characterization of the whole SARS-CoV-2 RNA genome identifies host cell target proteins vulnerable to re-purposed drugs. Cell, 184, 1865-1883. (2021). 

6.     Sun, L. #, K. Xu#, W. Huang #, Y.T. Yang#, P. Li, L. Tang, T. Xiong, and Q.C. Zhang. Predicting dynamic cellular protein-RNA interactions using deep learning and in vivo RNA structure. Cell Research, 31(5), 495-516, (2021).

7.     Sun, L.^#, F. M. Fazal^#, P. Li^#, J. P. Broughton, B. Lee, L. Tang, W. Huang, E. T. Kool, H. Y. Chang* and Q. C. Zhang* "RNA structure maps across mammalian cellular compartments." Nature Structural & Molecular Biology, 26 (4), 322-330 (2019).

团队名称：RNA结构组实验室

团队介绍：我们实验室专注于通过测序的方法获得细胞内全转录组的RNA结构信息，基于生物信息学以及人工智能的方法构建RNA结构与RNA翻译，RNA降解，RNA-蛋白相互作用等关系，最后应用在抗病毒药物开发，RNA疫苗设计等领域。