1. 技术开发方面

我们实验室对实验和计算方法的开发都很感兴趣。我们参与了许多技术的开发，包括亚细胞RNA结构测定（Sun et.al., NSMB, 2019 ）和基于人工智能的RBP-RNA相互作用预测（Sun et.al., Cell Research, 2021）。我们还对单细胞RNA结构测定，共转录瞬时RNA结构测定等问题感兴趣。

2. 解决生物学问题方面

RNA结构和RBP-RNA相互作用在转录后调控中起着关键作用。我们可以通过icSHAPE、PrismNet、CLIP等技术从RNA结构和RNA-蛋白相互作用的角度研究病毒的调控网络，并通过靶向病毒的重要结构元件或相互作用的宿主蛋白来开发抗病毒药物（Sun et.al., Cell, 2021）。上述的研究思路，即整合高通量测序、深度学习和实验验证，为系统研究RNA结合蛋白的作用提供了一个可行且高效的思路。同样，我们也可以研究RBPs在斑马鱼发育过程中是如何调节基因表达的等其他科学问题。

3. 技术应用方面

基于之前的工作，我们已经确定了大量与RNA翻译、RNA降解等相关的保守RNA结构元件。这些RNA结构可以被利用来设计RNA分子，更好地帮助疫苗和RNA靶向药物的开发。