孙磊
个人信息Personal Information
研究员 博士生导师 硕士生导师
性别:男
毕业院校:清华大学
学历:博士研究生毕业
学位:博士生
在职信息:在职
所在单位:生命科学学院
入职时间:2022-12-12
学科:生物化学与分子生物学
计算机应用技术
遗传学
计算数学
细胞生物学
办公地点:山东大学青岛校区第周苑F-123
联系方式:Web:RNAlab.cn
电子邮箱:sunlei0227@sdu.edu.cn
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1. 多方案的RNA结构探测
我们实验室对实验和计算方法的开发都很感兴趣。目前已经参与多个针对RNA结构探测技术的开发,包括亚细胞RNA结构测定(subStructure)、单细胞RNA结构测定等实验方法(scSHAPE),以及共转录瞬时RNA结构测定(nanoDISH)、整合突变停止提高结构解析精确性(STONE)等计算方法。
2. AI驱动的RNA调控研究
RNA具有复杂的调控网络,随着AI技术的发展,我们尝试将最新的AI技术应用于RNA调控的研究中。例如研究RNA结合蛋白与RNA的相互作用,RNA序列及结构对于RNA稳定性影响,RNA序列设计满足特定免疫要求,RNA细胞特异的调控等多方面的问题。
3. RNA疗法开发与应用
有了前面针对RNA结构以及RNA调控的研究,我们可以有针对的设计开发RNA药物,包括靶向特定RNA结构的小分子药物,靶向RNA的基因编辑系统开发以及RNA疫苗的优化。新的RNA疗法将应用在RNA病毒抑制,肿瘤治疗以及神经性疾病等多个方向。
- Lu Suiru* , Tang Yongkang* , Yin Shaozhen and Sun Lei#. RNA structure: implications in viral infections and neurodegenerative diseases. Advanced Biotechnology, 2(3), 2024.
- Deng Pujuna et.al.,. Structural RNA components supervise the sequential DNA cleavage in R2 retrotransposon. Cell, 186(13), 2865-2879.e20, 2024.
- Xu Yiran* , ... , Zhang Qiangfeng# and Lei Sun#. PrismNet: predicting protein-RNA interaction using in vivo RNA structural information. Nucleic Acids Research, gkad353, 2023.
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